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Le projet Debian Med prépare des paquets associés à la médecine, la recherche pré-clinique et aux sciences de la vie. Ses développements se concentrent essentiellement sur trois domaines : la pratique médicale, l'imagerie et la bio-informatique.

Au cours des années, plusieurs initiatives ont mis à disposition une impressionnante quantité de logiciels dans les disciplines scientifiques comme la chimie ou la bio-informatique. Debian Med n'est pas un concurrent à ces efforts mais un noyau de développeurs et une plateforme pour permettre ces développements. Le but ultime de notre travail d'empaquetage est de rendre Debian, et donc les distributions dérivées dont Ubuntu, les meilleures plateformes possibles pour la recherche dans la médecine et les sciences de la vie. Comme les paquets sont préparés selon les standards de la politique de Debian et qu'ils ont contribué aux dépôts de logiciels de Debian et d'Ubuntu, le projet Debian Med est classé en tant que Debian Pure Blend.

Contribuer à Debian Med

Du développeur à l'utilisateur, il existe une nombre important de tâches qui peuvent accueillir des participants. Tout d'abord, nous devons rester informés du paysage informatique en biologie et médecine. Les logiciels à empaqueter sont choisis en fonction de critères tels que les besoins des utilisateurs et l'uniformité de la distribution. Une fois dans Debian, leur qualité est surveillée et leurs bogues sont corrigés, si possible en collaboration avec le(s) mainteneur(s) original(aux). Tout ce travail ne serait pas très utile s'il restait confidentiel. Nous consacrons également du temps pour présenter le projet grâce au site http://www.debian.org ainsi que du temps pour faciliter l'intégration de nouveaux membres grâce à ce wiki.

Si vous souhaitez aider à rendre les logiciels de médecine et de biologie disponible aux utilisateurs Debian, merci de nous contacter sur la liste debian-med@lists.debian.org. Les étapes suivantes sont décrites de façon plus complète dans notre document de politique d’équipe qui décrit le flux de travail dans notre équipe et devrait vous guider étape par étape dans les règles que nous avons convenu.

Si vous parlez une autre langue que l'anglais, vous pouvez contribuer dès à présent aux traductions des descriptions de paquets sur http://ddtp.debian.org. Lorsque vous travaillez sur celles-ci, vous trouverez les objectifs immédiats d'améliorations des versions originales en anglais, aussi. A ces fins, cependant, vous aurez besoin d'accéder au dépôt du code source de Debian Med. Les tutoriels sont les bienvenus, ils guident les utilisateurs Debian dans l'utilisation de paquets. Vous pouvez également envisager d'écrire des articles pour des magazines, qu'ils soient en ligne ou en version imprimée.

Si vous souhaitez contribuer à Debian Med, vous pouvez aussi vous reporter à la page des tâches à faire.

Si vous êtes un nouveau venu et que vous n’avez aucune idée de comment contribuer, vous apprécierai de rejoindre le le programme de mentorat du mois.

Services pour les développeurs

Sites internet

Listes de diffusion et IRC

Les projets communautaires

Réunions

Utilisation de Subversion et de Git pour maintenir en groupe des paquets

Nos dépôts de code source sont gérés dans les dépôts Subversion et Git. Chaque développeur Debian et membre du projet Alioth debian-med dispose des droits d'écriture.

Notre politique de groupe explique tous les détails. Pour les débutants, nous recommandons la lecture des pages suivantes : SSH, Subversion et Git.

Références

Lorsque vous utilisez Debian ou Ubuntu pour votre travail, vous trouverez peut-être approprié de citer l'une des publications suivantes:

  1. S. Möller, H. N. Krabbenhöft, A. Tille, D. Paleino, A. Williams, K. Wolstencroft, C. Goble, R. Holland, D. Belhachemi, C. Plessy (2010) "Community-driven computational biology with Debian Linux" BMC Bioinformatics, 11(Suppl 12):S5

  2. A. Tille, S. Möller, M. Hanke, Y. Halchenko (2011) "Debian Med - Integrated software environment for all medical purposes based on Debian GNU/Linux", Med@Tel 2011

Pages associées

Voir aussi